Войти Регистрация

Docx

  • Рефераты
  • Дипломные работы
  • Прочее
    • Презентации
    • Рефераты
    • Курсовые работы
    • Дипломные работы
    • Диссертациии
    • Образовательные программы
    • Инфографика
    • Книги
    • Тесты

Информация о документе

Цена 35000UZS
Размер 658.2KB
Покупки 0
Дата загрузки 29 Май 2025
Расширение docx
Раздел Курсовые работы
Предмет Биология

Продавец

Telzor Uchun

Дата регистрации 21 Апрель 2025

24 Продаж

DNK va RNK nukleotidlar ketma-ketliklari ma’lumot bazalari

Купить
O ‘ZBEKISTON RESPUBLIKASI OLIY  TA’LIM, FAN VA INOVATSIYA
VAZIRLIGI
URGANCH  DAVL A T UNIVERSITETI
Tabiiy fanlar fakulteti Biologiya yo’nalishi
191- guruh talabasi Arslonova Mavluda ning
Bioinfarmatika fanidan
KURS ISHI
Mavzu:   DNK va RNK nukleotidlar ketma-ketliklari  ma’lumot bazalari
      
              Topshirdi:                                                                               Arslonova M
Qabul qildi:                                                                                Babajanov I
Urganch-2023
1 Reja:
Kirish.
I bob. Adabiyotlar sharxi.
II bob. Asosiy qism.
2.1. Nukleotidlar strukturasi va sintezi
2.2.  DNK va RNK bazalari
2.3. DNK va RNK nukleotid bazakari ketma-ketliklari
III bob. Xulosa.
Foydalanilgan adabiyotlar.
2 Kirish
Nukleotidlar   azotli   asos,   pentoza   shakar   va   fosfatdan   tashkil   topgan   organik
molekulalardir.   Ular   nuklein   kislota   polimerlarining   monomerik   birliklari   bo'lib
xizmat   qiladi   -   deoksiribonuklein   kislotasi   (DNK)   va   ribonuklein   kislotasi   (RNK),
ikkalasi   ham   Yerdagi   barcha   hayot   shakllarida   muhim   biomolekulalardir.
Nukleotidlar   ratsionda   olinadi   va   jigar   tomonidan   umumiy   oziq   moddalardan   ham
sintezlanadi.   Nukleotidlar   uchta   subbirlik   molekulalaridan   iborat:   nukleobaza,   besh
uglerodli shakar (riboza yoki dezoksiriboza) va bir-uch fosfatdan iborat fosfat guruhi.
DNKdagi   to'rtta   nukleobazalar   guanin,   adenin,   sitozin   va   timindir;   RNKda   timin
o'rniga urasil ishlatiladi. Nukleotidlar asosiy, hujayra darajasidagi metabolizmda ham
markaziy   rol   o'ynaydi.   Ular   kimyoviy   energiya   -   nukleozid   trifosfatlar,   adenozin
trifosfat   (ATP),   guanozin   trifosfat   (GTP),   sitidin   trifosfat   (CTP)   va   uridin   trifosfat
(UTP) shaklida - energiya talab qiladigan ko'plab hujayra funktsiyalari uchun hujayra
bo'ylab ta'minlaydi. : aminokislotalar, oqsil va hujayra membranasi sintezi, hujayra va
hujayra   qismlarini   (ichki   va   hujayralararo)   harakatlantirish,   hujayra   bo linishi   vaʻ
hokazo   Bu.ndan   tashqari,   nukleotidlar   hujayra   signalizatsiyasida   (tsiklik   guanozin
monofosfat yoki cGMP va siklik adenozin monofosfat yoki cAMP) ishtirok etadi va
fermentativ reaktsiyalarning muhim kofaktorlariga (masalan, koenzim A, FAD, FMN,
NAD   va   NADP   +)   qo'shiladi.   Eksperimental   biokimyoda   nukleotidlarni
radionukleotidlar   hosil   qilish   uchun   radionuklidlar   yordamida   radioyorliqlash
mumkin.   5-nukleotidlar,   shuningdek,   umami   ta'mini   yaxshilash   uchun,   ko'pincha
xamirturush   ekstrakti   shaklida   oziq-ovqat   qo'shimchasi   sifatida   lazzat
kuchaytirgichlarda qo'llaniladi.
DNK   ma'lumotlar   bazasi   yoki   DNK   ma'lumotlar   banki   genetik   kasalliklarni
tahlil   qilish,   kriminologiya   uchun   genetik   barmoq   izlari   yoki   genetik   genealogiyada
foydalanish   mumkin   bo'lgan   DNK   profillarining   ma'lumotlar   bazasi.   DNK
ma'lumotlar   bazalari   ommaviy   yoki   xususiy   bo'lishi   mumkin,   eng   kattalari   milliy
DNK ma'lumotlar bazalari.
3 DNK   ma'lumotlar   bazalari   ko'pincha   sud-tibbiyot   tekshiruvlarida   qo'llaniladi.
Jinoyat   sodir   bo'lgan   joyni   DNK   profili   ma'lumotlar   bazasida   saqlangan   shaxs   bilan
bog'lash   uchun   milliy   DNK   ma'lumotlar   bazasidan   o'yin   tuzilganda,   bu   havola
ko'pincha   sovuq   zarba   deb   ataladi.   Sovuq   zarba   ma'lum   bir   shaxsni   jinoyat   sodir
bo'lgan joyga bog'lashda  alohida ahamiyatga  ega, lekin DNK ma'lumotlar  bazasidan
foydalanmasdan   qilingan   DNK   moslashuvidan   ko'ra   kamroq   dalil   qiymatiga   ega.
Tadqiqotlar   shuni   ko'rsatadiki,   jinoyatchilarning   DNK   ma'lumotlar   bazasi
jinoyatchilik darajasini pasaytiradi.
4 I bob. Adabiyotlar sharxi.
Ko'p   yillar   davomida   filogenetika   asosan   sistematika   bilan   chegaralangan
mavzu edi. Biroq "molekulyar inqilob" dan keyin filogeniyalar biologiya fanlarining
deyarli barcha sohalariga singib keta boshladi va shundan beri ular asosiy biologiyada
keng tarqalgan vositalarga aylandi. Afsuski, bu siljish bilan birga filogenetik daraxtlar
noto'g'ri   talqin   qilinishiga   moyil   ekanligini   anglab   yetdi.   Filogenetik   daraxt
evolyutsiya tarixini tasvirlashning ma'lum bir turini ta'minlaydi (O'Hara 1992) va bu
hikoya   shaklini   to'g'ri   talqin   qilish   uchun   "daraxt   fikrlash"   ni   tushunish   kerak.
Sistematiklar, odatda, filogenetik daraxtni talqin qilish oson, deb hisoblashadi. Biroq,
haqiqiy dunyoda bu aniq emas va daraxtni o'ylash odatiy hol  sifatida qabul qilinishi
mumkin   emas   (Sandvik   2008).   Devid   Baum   va   Steysi   Smit   o'zlarining   so'nggi
kitoblarida   ta'kidlaganidek   Daraxt   o'ylash   (xv-bet),   asosiy   masala:   daraxt   tafakkuri
ommaviy   madaniyatdagi   evolyutsiya   haqidagi   standart   tasavvurlarga   zid   keladi.   Biz
nima   uchun   bunday   bo'lishi   kerakligini   bilmaymiz,   lekin   minglab   talabalar   bilan
ishlashdan   bilib   oldikki,   odamlar   qarama-qarshi   tayyorgarliksiz,   evolyutsiyaga   bir
o'lchovli   va  progressive   qarashga  ega.  Biz   evolyutsiyani  boshlanishi,  o'rtasi   va  oxiri
bo'lgan   hikoya   sifatida   aytib   berishga   moyilmiz.   Shu   nuqtai   nazardan,   filogenetik
daraxtlar   chiziqli   emas,   balki   shoxlangan   va   fraktal   bo'lib,   bir   boshlanishi   va   ko'p
sonlari bir xil darajada amal qiladi. Daraxt o'ylash qisqasi, intuitivdir.  So'nggi o'n yil
ichida   ushbu   hodisani   o'rganayotgan   odamlarning   butun   yozgi   sanoati   paydo   bo'ldi.
Ayniqsa,   o‘quvchilarga   ta’lim-tarbiya   berish   alohida   tashvish   uyg‘otadi.   Talabalar
filogenetik   daraxtlarni   qanday   va   nima   uchun   noto'g'ri   tushunishlarini   va   bu   borada
nima qilishimiz mumkinligini tushunishda katta yutuqlarga erishildi (Goldsmith 2003
Baum va boshq. 2005 Meir va boshq. 2007 Sandvik 2008 Catley et al. 2010 Miesel
2010 Morabito va boshq. va boshqalar  5 2010, , 2011 Halverson va boshqalar 2011
Novick   and   Catley   2013).   Xabar   aniq:   odamlar   transformatsion   evolyutsiyani
osonlikcha   tushunadi,   lekin   o'zgaruvchan   evolyutsiyani   emas,   agar   ularni   o'rgatish
(yoki ularni o'qitish) uchun alohida harakat qilinmasa. Internetdan olingan bir iqtibos
5 bu masalani ko'rsatadi: Rostini aytsam, biologiyaga qiziqa boshlaganimda filogenetik
daraxtlarni yomon ko'rardim. Ularga qarash zerikarli edi va ularni tushunishning iloji
yo'q edi. Men ular evolyutsion munosabatlarni ko'rsatishini bilardim, lekin bu usullar
yordamida   javob   berilishi   mumkin   bo'lgan   turli   ilovalar   va   savollar   haqida   hech
qanday   tasavvurga   ega   emas   edim.   Odamlar   har   qanday   ta'lim   muhitiga   ma'lum   bir
taxminlarni olib kelishadi, bu esa ushbu muhitga mos kelmasligi  mumkin. Bu tabiiy
taxminlar   ularning   oldingi   tayyorgarliklari,   ijtimoiy   kelib   chiqishi   va   shaxsiy
tajribalaridan  kelib chiqadi.  O'rganilayotgan  narsa  ularning  oldindan  mavjud  bo'lgan
fikrlash   jarayonlariga   moslashtiriladi   va   ularga   aytilgan   va   ko'rsatilgan   narsalar   ana
shu   taxminlar   asosida   izohlanadi.   Xenshou   Uord   (1925)   ta'kidlaganidek:   o'rtacha
odam.   .   .   evolyutsiyani   "inson   maymunlardan   kelib   chiqqan   degan   ta'limot"   deb
hisoblaydi va u bu nazariyadan shu qadar zavqlanadi yoki xafa bo'ladiki, uning butun
ongi   shu   bilan   band.   Uning   kontseptsiyasi   kulgili   tarzda   yolg'ondir.   Jon   Dou   bu
tushunchadan voz kechmaguncha va yangi boshlamaguncha, u mavzuni hech qachon
tushunmaydi.   Biroq,   ko'plab   professional   biologlarning   daraxtlarni   talabalarga
qaraganda   yaxshiroq   tushuna   olmasligi   ham   bir   xil   tashvish   uyg'otadi   (Krell   and
Cranston   2004   Crisp   and   Cook   2005   Gregory   2008   Omland   et   al.   2008   Sandvik
2009).   Bu   nafaqat   kasbda   chalkashliklarni   keltirib   chiqaradi,   balki   mutaxassis
bo'lmaganlar   bilan   muloqot   qilishda   ham   asoratlarni   keltirib   chiqaradi.   Bir   qator
odamlar   filogenetika   sinfda,   darsliklarda   va   muzeylarda   (Clark   2001   Catley   and
Novick   2008   Hellström   2011   MacDonald   and   Wiley   2012   Torrens   and   Barahona
2012) kabi turli sharoitlarda qanday yaxshi yetkazilishini o'rganib chiqdilar. bir xilda
noqulay.   Ehtimol,   eng   katta   muammo   bu   filogenetik   daraxtlarni   taqdim   etish   va
tavsiflash uslubidagi  noaniqlikdir – filogeniyalarni evolyutsion bog'liqlikning ifodasi
sifatida   tushunish   kognitiv   jihatdan   murakkab   vazifadir   va   noaniqlik   bu   jarayonda
hech   qanday   rol   o'ynamaydi.   Ikkita   eng   katta   muammo   shundaki,   (i)   odamlar
ko'pincha   nasllarning   tarmoqlanish   tartibiga   qaraganda   filogeniyaning   uchlaridagi
taksonlarning   tartibiga   ko'proq   e'tibor   berishadi   va   (ii)   ular   bitta   naslni   noto'g'ri
6 ta'kidlaydilar. filogeniya, ular daraxtning "asosiy novdasi" sifatida ko'rishadi, boshqa
nasllar   yon   shoxlar   (shuningdek,   ba'zi   novdalar   "bazal"   va   boshqalar   emas).
Shubhasiz,   biz   talabalar   va   mutaxassis   bo'lmaganlar   uchun   darslik   kerak   va   Daraxt
tafakkuri:   filogenetik   biologiyaga   kirish   o'sha   kitob   bo'lishi   mo'ljallangan.   Oddiyroq
(Hall   2011)   yoki   yanada   rivojlangan   (Lemey   va   boshq.   2009)   va   hatto   to'ldiruvchi
(Felsenstein  2004) bo'lgan boshqa kitoblar ham  mavjud, ammo keng o'rtada haqiqiy
raqobat   yo'q.   Mualliflar   ushbu   kitob   6   ustida   ancha   vaqtdan   beri   ishlamoqda,
muammo   haqidagi   dastlabki   fikrlari   Baum   va   boshqalar   tomonidan   taqdim   etilgan.
(2005),  bog'langan   veb-sahifa   va   Baum   va  Offnerning   (2008)   so'nggi   hissalari   bilan
birga.   Bu   kitob   o‘quv   qo‘llanmasi   bo‘lib,   u   pedagogik   jihatdan   qat’iy   bo‘lib,
talabaning   filogenetik   daraxtlar   va   ularning   talqini   haqidagi   oldingi   tushunchalarini
baholash uchun dastlabki sinovdan o‘tkaziladi, so‘ngra har bir bobning oxirida davom
etayotgan bilimlarni o‘zlashtirishni baholash uchun testlar o‘tkaziladi. Bunday kitobni
professionallar   uchun   manba   kitobi   sifatida   o'qib   bo'lmaydi,   lekin   u   o'zining   asosiy
maqsadini qamrab oluvchi kirish darajasidagi kitob sifatida amalga oshiradi. Kitobda
ko'p   odamlar   va   ularning   qahramonlariga   e'tibor   qaratilgan.   U   individlar   va   turlarga
nisbatan   daraxt   tafakkurini   muhokama   qilishdan   boshlanadi,   so'ngra   xarakter
evolyutsiyasini   ko'rib   chiqishni   davom   ettiradi,   so'ngra   turdagi   daraxtlar   ichida   gen
daraxtlari   g'oyasini   rivojlantiradi.   U   parsimoniya,   minimal   masofa,   maksimal
ehtimollik va Bayes metodologiyasi kabi odatiy daraxt xulosasi usullarini muhokama
qilish   bilan   yakunlanadi   va   nihoyat   statistic   gipoteza   testini   taqdim   etadi.   Yozuv
uslubi juda aniq, potentsial murakkab tushunchalar odatda o'xshashlik bilan kiritiladi
va boblarni qalampirlaydigan biologik misollar mos keladi.  Individuallar va ularning
qahramonlariga e'tibor kitobga "parsimonlik" tuyg'usini beradi, deb tuyulishi mumkin,
bunda xarakter evolyutsiyasi xarakter-holat o'zgarishlarini hisoblash orqali yaxshiroq
kiritiladi. Biroq, bu Hennigian mantig'i daraxtlarni tushunishni boshlash uchun yaxshi
joy   ekanligi   haqidagi   g'oyani   amalga   oshirishdir   -   bu   daraxtlar   nimani   anglatishini
o'ylashga   yordam   beradi.   Boshqa   tomondan,   molekulyar   biologlar   ko'pincha
7 filogenetik   usullar   va   hozirda   mavjud   bo'lgan   dasturiy   ta'minot   paketlarining
ko'pligini   ta'kidlaydilar   va   amaliyotchilarga   o'rmon   bo'ylab   harakatlanishlariga
yordam berish uchun daraxtlar bilan tanishtirishga e'tibor berishadi. Bu filogenetikaga
juda   boshqacha   pedagogik   yondashuv.
8 II bob. Asosiy qism.
2.1. Nukleotidlar strukturasi va Sintezi
Nukleotid   uchta   o'ziga   xos   kimyoviy   quyi   birlikdan   iborat:   besh   uglerodli
shakar   molekulasi,   nukleobaza   (ikkitasi   birgalikda   nukleozid   deb   ataladi)   va   bitta
fosfat   guruhi.   Uchalasi   ham   birlashganda,   nukleotid   fosfat   guruhini   qancha   fosfat
tashkil qilishiga qarab, "nukleozid monofosfat", "nukleozid difosfat" yoki "nukleozid
trifosfat"   deb   ham   ataladi.   Nuklein   kislotalarda   nukleotidlar   purin   yoki   pirimidin
asosini,   ya'ni   azotli   asos   sifatida   ham   tanilgan   nukleobaza   molekulasini   o'z   ichiga
oladi   va   agar   shakar   riboza   bo'lsa,   ribonukleotidlar   yoki   shakar   deoksiriboza   bo'lsa,
deoksiribonukleotidlar deb ataladi. Alohida fosfat molekulalari ikki qo'shni nukleotid
monomerlaridagi shakar-halqa molekulalarini takroriy ravishda bog'laydi va shu bilan
nuklein   kislotaning   nukleotid   monomerlarini   uchi   uchi   uzun   zanjirga   bog'laydi.
Shakar va fosfat molekulalarining bu zanjirli birikmalari bitta yoki ikkita spiral uchun
"umurtqali"   ipni   hosil   qiladi.   Har   qanday   bitta   ipda   zanjirning   birlashmalarining
kimyoviy   yo'nalishi   (yo'nalishi)   5'-uchidan   3'-uchigacha   (o'qing:   5   asosiy   uchidan   3
tagacha)   -   beshta   uglerod   joyiga   ishora   qiladi.   qo'shni   nukleotidlardagi   shakar
molekulalari.   Ikki   tomonlama   spiralda   ikkita   ip   qarama-qarshi   yo'nalishda
yo'naltirilgan   bo'lib,   bu   tayanch   juftliklari   o'rtasida   tayanch   juftligini   va   bir-birini
to'ldirishni   ta'minlaydi,   bularning   barchasi   DNKda   topilgan   kodlangan   ma'lumotni
nusxalash   yoki   transkripsiya   qilish   uchun   zarurdir.   Nuklein   kislotalar   nuklein
kislotalarning   monomer   birliklari   bo'lgan   nukleotidlardan   yig'ilgan   polimerik
makromolekulalardir. Purin asoslari adenin va guanin va pirimidin asosli sitozin ham
DNK,   ham   RNKda,   pirimidin   asoslari   timin   (DNKda)   va   urasil   (RNKda)   faqat
bittasida uchraydi. Adenin ikkita vodorod aloqasi bilan timin bilan, guanin esa uchta
vodorod bog'i bilan sitozin bilan asos juftini hosil qiladi. Singular nukleotidlar nuklein
kislota   polimerlarini   qurish   uchun   qurilish   bloklari   bo'lishdan   tashqari,   hujayra
energiyasini   saqlash   va   ta'minlash,   hujayra   signalizatsiyasi,   oqsillar   va   boshqa
signalizatsiya   molekulalarining   faolligini   modulyatsiya   qilish   uchun   ishlatiladigan
9 fosfat   guruhlari   manbai   va   fermentativ   kofaktorlar   sifatida   rol   o'ynaydi.   ,   ko'pincha
redoks   reaktsiyalarini   amalga   oshiradi.   Signal   siklik   nukleotidlar   fosfat   guruhini   bir
xil   shakar   molekulasi   bilan   ikki   marta   bog'lash,   shakarning   5'   va   3'-   gidroksil
guruhlarini   bog'lash   orqali   hosil   bo'ladi.     Ba'zi   signalizatsiya   nukleotidlari   standart
bitta   fosfat   guruhi   konfiguratsiyasidan   farq   qiladi,   chunki   shakarning   turli
pozitsiyalariga   bir   nechta   fosfat   guruhlari   biriktirilgan.   Nukleotid   kofaktorlari
nikotinamid  va  flavinni  o'z   ichiga  olgan  glikozid  aloqasi  orqali  shakarga   bog'langan
kengroq kimyoviy guruhlarni o'z ichiga oladi va ikkinchi holda, riboza shakar boshqa
nukleotidlarda ko'rinadigan halqani hosil qilishdan ko'ra chiziqli bo'ladi.
 
Uch   nukleotidning   strukturaviy   elementlari   -   markazda   bir,   ikki   yoki   uchta
fosfatlar   nukleozidga   (sariq,   ko'k,   yashil   rangda)   biriktirilgan:   1-chi,   nukleozid
monofosfat   deb   ataladigan   nukleotid   fosfat   (qizil   rangda)   qo'shilishi   bilan   hosil
bo'ladi.);   2-dan,   ikkinchi   fosfat   qo'shilsa,   nukleozid   difosfat   hosil   bo'ladi;   3-chi,
uchinchi fosfat qo'shilsa, nukleozid trifosfat hosil bo'ladi. + Azotli asos (nukleobaza)
"Asosiy"   va   "glikozidik   bog'lanish"   (shakar   aloqasi)   bilan   ko'rsatilgan.   Barcha   besh
asosiy   yoki   kanonik   asoslar   -   purinlar   va   pirimidinlar   -   o'ng   tomonda   (ko'k   rangda)
chizilgan. 
Nukleotidlar   ham   in   vitro,   ham   in   vivo   turli   vositalar   bilan   sintezlanishi
mumkin.  Himoya   guruhlari   nukleotidlarni  laboratoriya  ishlab  chiqarishda   ishlatilishi
mumkin. Tozalangan nukleozid fosforamidit hosil qilish uchun himoyalangan, undan
10 keyin   tabiatda   topilmagan   analoglarni   olish   va/yoki   oligonukleotidni   sintez   qilish
uchun foydalanish mumkin. Nukleotidlar de novo sintezlanishi yoki qutqaruv yo'llari
orqali   qayta   ishlanishi   mumkin.   De   novo   nukleotid   sintezida   ishlatiladigan
komponentlar   uglevod   va   aminokislotalar   almashinuvining   biosintetik
prekursorlaridan, ammiak va karbonat angidriddan olinadi. Yaqinda uyali bikarbonat
almashinuvi   mTORC1   signali   orqali   boshqarilishi   ham   ko'rsatildi.   Jigar   barcha   to'rt
nukleotidning de novo sintezining asosiy organidir. Pirimidinlar va purinlarning yangi
sintezi   ikki   xil   yo'l   bilan   boradi.   Pirimidinlar   birinchi   navbatda   sitoplazmadagi
aspartat   va   karbamoil-fosfatdan   umumiy   halqali   tuzilish   orotik   kislotagacha
sintezlanadi, fosforlangan ribosil birligi kovalent bog'langan. Biroq, purinlar birinchi
navbatda halqa sintezi sodir bo'lgan shakar shablonidan sintezlanadi. Ma'lumot uchun,
purin   va   pirimidin   nukleotidlarining   sintezi   ma'lum   bir   organella   ichida   emas,   balki
hujayra   sitoplazmasidagi   bir   nechta   fermentlar   tomonidan   amalga   oshiriladi.
Nukleotidlar   parchalanadi,   shuning   uchun   foydali   qismlar   yangi   nukleotidlarni
yaratish   uchun   sintez   reaktsiyalarida   qayta   ishlatilishi   mumkin.   CTP   va   UTP
pirimidinlarining   sintezi   sitoplazmada   sodir   bo'ladi   va   glutamin   va   CO2   dan
karbamoil   fosfat   hosil   bo'lishi   bilan   boshlanadi.   Keyinchalik,   aspartat
karbamoiltransferaza   aspartat   va   karbamoil   fosfat   o'rtasidagi   kondensatsiya
reaktsiyasini   katalizlaydi   va  karbamoil   aspartik  kislota   hosil   qiladi,   u  dihidroorotaza
tomonidan   4,5-dihidroorotik   kislotaga   aylanadi.   Ikkinchisi   dihidrorotat   oksidaza
ta'sirida orotatga aylanadi.
11 Hayotning kelib chiqishi haqidagi nazariyalar ishonchli prebiyotik sharoitlarda
hayotning   asosiy   qurilish   bloklarini   shakllantirishga   imkon   beradigan   kimyoviy
yo'llarni   bilishni   talab   qiladi.   RNK   dunyosi   gipotezasi   ibtidoiy   sho'rvada   erkin
suzuvchi ribonukleotidlar, asosiy molekulalar bo'lib, ular ketma-ket qo'shilib, RNKni
hosil   qiladi.   RNK   kabi   murakkab   molekulalar   reaktivligi   fizik-kimyoviy   jarayonlar
bilan boshqariladigan kichik molekulalardan paydo bo'lgan bo'lishi kerak. RNK purin
va pirimidin nukleotidlaridan iborat bo'lib, ularning ikkalasi ham ishonchli ma'lumot
uzatish   uchun   zarurdir   va   shu   bilan   Darvin   evolyutsiyasi.   Bekker   va   boshqalar.
pirimidin   nukleozidlarini   faqat   nam-quruq   davrlar   orqali   boshqariladigan   kichik
molekula   va   ribozadan   qanday   qilib   sintez   qilish   mumkinligini   ko'rsatdi.[9]   Purin
nukleozidlari   ham   xuddi   shunday   yo'l   bilan   sintezlanishi   mumkin.   5'-mono-   va   di-
fosfatlar   ham   fosfat   o'z   ichiga   olgan   minerallardan   tanlab   hosil   bo'lib,   purin   va
pirimidin   asoslari   bilan   bir   vaqtda   poliribonukleotidlarning   shakllanishiga   imkon
beradi. Shunday qilib, oddiy atmosfera yoki vulqon molekulalaridan boshlab purin va
pirimidin RNK qurilish bloklariga nisbatan reaktsiya tarmog'ini yaratish mumkin. 
12 2.2.  DNK va RNK bazalari
Sud-tibbiy   ma'lumotlar   bazasi   -   bu   shaxslarning   DNK   profillarini   saqlash
uchun   markazlashtirilgan   DNK   ma'lumotlar   bazasi   bo'lib,   jinoyat   joyidan   olingan
DNK   namunalarini   saqlangan   profillar   bilan   solishtirish   imkonini   beradi.   Sud-tibbiy
ma'lumotlar bazasining eng muhim vazifasi gumon qilinayotgan shaxs va voqea joyi
biomarkerlari o'rtasidagi moslikni yaratish, so'ngra jinoiy tergovni qo'llab-quvvatlash
uchun   dalillarni   taqdim   etish,   shuningdek,   jinoiy   tergovda   potentsial
gumonlanuvchilarni   aniqlashga   olib   keladi.   Milliy   DNK   ma'lumotlar   bazalarining
aksariyati sud-tibbiyot maqsadlarida foydalaniladi.
Interpol   DNK   ma'lumotlar   bazasi   jinoiy   tergovda   qo'llaniladi.   Interpol   DNK
Gateway   deb   nomlangan   avtomatlashtirilgan   DNK   ma'lumotlar   bazasini   yuritadi,
unda a'zo davlatlar tomonidan jinoyat sodir bo'lgan joylar, bedarak yo'qolgan shaxslar
va noma'lum  jasadlardan  to'plangan DNK profillari  mavjud.[5]  DNK Gateway  2002
yilda tashkil etilgan va 2013 yil oxirida u 69 a'zo davlatdan 140 000 dan ortiq DNK
profiliga ega edi. Boshqa DNK ma'lumotlar bazalaridan farqli o'laroq, DNK Gateway
faqat   ma'lumot   almashish   va   taqqoslash   uchun   ishlatiladi,   u   DNK   profilini   hech
qanday   shaxs   bilan   bog'lamaydi   va   shaxsning   jismoniy   yoki   psixologik   holati
ma'lumotlar bazasiga kiritilmaydi. 
Milliy   yoki   sud-tibbiy   DNK   ma'lumotlar   bazasi   politsiyadan   tashqari
maqsadlarda   mavjud   emas.   DNK   profillari   genealogik   maqsadlarda   ham   ishlatilishi
mumkin,   shuning   uchun   genealogik   DNK   test   natijalarining   DNK   profillarini
saqlaydigan   alohida   genetik   genealogiya   ma'lumotlar   bazasini   yaratish   kerak.
GenBank   -   bu   ko'plab   genetik   genealoglar   tomonidan   taqdim   etilgan   genom   ketma-
ketligini   saqlaydigan   ommaviy   genetik   genealogiya   ma'lumotlar   bazasi.   Hozirgacha
GenBank 140 000 dan ortiq ro'yxatdan o'tgan tashkilotlardan olingan ko'p sonli DNK
ketma-ketliklarini   o'z   ichiga   olgan   va   ketma-ketlik   ma'lumotlarining   yagona   va   har
tomonlama   to'planishini   ta'minlash   uchun   har   kuni   yangilanadi.   Ushbu   ma'lumotlar
bazalari   asosan   alohida   laboratoriyalardan   yoki   keng   ko'lamli   sekvensiya
13 loyihalaridan   olinadi.   GenBank-da   saqlangan   fayllar   turli   guruhlarga   bo'lingan,
masalan,   BCT   (bakterial),   VRL   (viruslar),   PRI   (primatlar)   ...   va   hokazo.   Odamlar
GenBank-ga   NCBI-ning   qidirish   tizimidan   kirishlari   mumkin   va   keyin   GenBank
ichidagi   ma'lum   bir   ketma-ketlikni   aniqlash   yoki   ikkita   ketma-ketlik   o'rtasidagi
o'xshashlikni topish uchun "BLAST" funksiyasidan foydalanishlari mumkin. 
Tibbiy   DNK   ma'lumotlar   bazasi   -   bu   tibbiy   ahamiyatga   ega   bo'lgan   genetik
o'zgarishlarning   DNK   ma'lumotlar   bazasi.   U   tibbiy   yozuvlari   va   turmush   tarzi
tafsilotlarini aks ettira oladigan shaxsning DNKsini to'playdi. DNK profillarini yozib
olish orqali olimlar genetik muhit va ayrim kasalliklarning (masalan, yurak-qon tomir
kasalliklari yoki saraton) paydo bo'lishi o'rtasidagi o'zaro ta'sirni bilib olishlari va shu
bilan   ushbu   kasalliklarni   nazorat   qilishda   ba'zi   yangi   dorilar   yoki   samarali   davolash
usullarini   topishlari   mumkin.   U   ko'pincha   Milliy   sog'liqni   saqlash   xizmati   bilan
hamkorlik   qiladi.   Milliy   DNK   ma'lumotlar   bazasi   -   bu   aholining   DNK   profillarini
saqlash   uchun   hukumat   tomonidan   yuritiladigan   DNK   ma'lumotlar   bazasi.   Har   bir
DNK   profili   PCRga   asoslangan   va   STR   (Qisqa   tandem   takrorlari)   tahlilidan
foydalanadi.   Ular   odatda   sud-tibbiyot   maqsadlarida   qo'llaniladi,   jumladan   potentsial
jinoyatchilarning DNK profillarini qidirish va moslashtirish.
2009   yilda   Interpol   o'sha   paytda   dunyoda   54   ta   milliy   DNK   politsiya
ma'lumotlar   bazalari   mavjudligini   va   yana   26   ta   davlat   uni   ishga   tushirishni
rejalashtirganini   ma'lum   qildi.   Evropada   Interpol   31   ta   milliy   DNK   ma'lumotlar
bazasi   mavjudligini   va   yana   oltita   rejalashtirilganligini   ma'lum   qildi.[9]   Sud
ekspertizasi  institutlarining Evropa  tarmog'i  (ENFSI)   DNK  ishchi   guruhi   2014 yilda
DNK   ma'lumotlar   bazasini   boshqarish   va   DNK   ma'lumotlar   bazalarini   tekshirish
bo'yicha   ko'rsatmalar   bo'yicha   33   ta   tavsiya   berdi.   Boshqa   davlatlar   shaxsiy   ishlab
chiqilgan   DNK   ma'lumotlar   bazalarini   qabul   qildilar,   masalan,   Bode   dbSEARCHni
qabul   qilgan   Qatar.   Odatda,   individual   genomning   kichik   bir   qismi   yuqori
individuallikka ega bo'lgan 13 yoki 16 mintaqadan namuna olinadi. Qo'shma Shtatlar
milliy   DNK   ma'lumotlar   bazasi   Birlashtirilgan   DNK   indeks   tizimi   (CODIS)   deb
14 ataladi. U uchta darajada saqlanadi: milliy, davlat va mahalliy. Har bir daraja o'zining
DNK   indeks   tizimini   amalga   oshirdi.   Milliy   DNK   indeks   tizimi   (NDIS)   DNK
profillarini   milliy   miqyosda   ishtirok   etgan   laboratoriyalar   o'rtasida   almashish   va
solishtirish   imkonini   beradi.   Har   bir   davlat   DNK   indeks   tizimi   (SDIS)   DNK
profillarini turli davlatlar laboratoriyalari o'rtasida almashish va solishtirish imkonini
beradi   va   mahalliy   DNK   indeks   tizimi   (LDIS)   DNK   profillarini   mahalliy   saytlarda
to'plash   va   SDIS   va   NDISga   yuklash   imkonini   beradi.   CODIS   dasturi   barcha   DNK
indeks tizimlarini uchta darajada birlashtiradi va bog'laydi. CODIS har bir ishtirokchi
laboratoriya   saytida   o'rnatiladi   va   boshqa   laboratoriyalarga   ulanish   uchun   Jinoiy
Adliya Axborot Tizimlarining Keng Tarmoq Tarmog'i (CJIS WAN) deb nomlanuvchi
mustaqil   tarmoqdan   foydalanadi.   NDIS   da   nomuvofiq   o yinlar   sonini   kamaytirishʻ
uchun   Mahkum   qilingan   jinoyatchilar   indeksi   profilni   yuklash   uchun   barcha   13
CODIS   STR   bo lishini   talab   qiladi.   Sud-tibbiy   profillar   yuklash   uchun   faqat   10   ta	
ʻ
STR bo'lishini talab qiladi.
2011   yil   holatiga   ko'ra,   CODIS   doirasida   9   milliondan   ortiq   yozuvlar
saqlangan.   2011-yil   mart   oyi   holatiga   ko ra,   361.176   sud-tibbiy   profil   va   9.404.747	
ʻ
jinoyatchi   profili   to plangan,   bu   dunyodagi   eng   katta   DNK   ma lumotlar   bazasiga	
ʻ ʼ
aylanadi.   Xuddi   shu   sanaga   kelib,   CODIS   138   700   dan   ortiq   gugurtlarni   so'rovlar
bo'yicha   ishlab   chiqardi   va   133   400   dan   ortiq   tergovga   yordam   berdi.   DNK
ma'lumotlar   bazalarining   jamoatchilik   tomonidan   ma'qullanishi   ko'plab   shtatlarning
o'z   DNK   ma'lumotlar   bazalarini   yaratish   va   kengaytirishni   ko'rsatdi.   DNK
ma'lumotlar   bazasini   kengaytirgan   Kaliforniya   taklifi   69   (2004)   kabi   siyosiy   chora-
tadbirlar   allaqachon   yordam   bergan   tergovlar   sonining   sezilarli   o'sishiga   olib   keldi.
AQSHning   qirq   to‘qqiz   shtatida,   Aydaxo   shtatidan   tashqari,   zo‘ravon
jinoyatchilarning   DNK   profillari   saqlanadi   va   ko‘pchilik   gumonlanuvchilarning
profillarini   saqlaydi.   2017   yilgi   tadqiqot   shuni   ko'rsatdiki,   AQSh   shtatlaridagi   DNK
ma'lumotlar   bazalari   "profillangan   jinoyatchilar   tomonidan   jinoyat   sodir   etilishining
oldini   oladi,   jinoyatlar   darajasini   pasaytiradi   va   an'anaviy   huquqni   muhofaza   qilish
15 vositalariga qaraganda ancha tejamkor". CODIS, shuningdek, bedarak yo'qolganlarni
topish   va   inson   qoldiqlarini   aniqlash   uchun   ishlatiladi.   U   bedarak   yo'qolgan
shaxslarning   milliy   DNK   ma'lumotlar   bazasiga   ulangan;   oila   a'zolari   tomonidan
taqdim   etilgan   namunalar   Shimoliy   Texas   universiteti   Inson   identifikatsiya   markazi
tomonidan   ketma-ketlikda   bo'lib,   u   ham   Milliy   bedarak   yo'qolgan   va   noma'lum
shaxslar   tizimini   boshqaradi.   UNTCHI   ham   yadroviy,   ham   mitoxondrial   DNKni
ketma-ketlashtirishi  mumkin.  Mudofaa  vazirligi   harbiy  xizmatchilarning qoldiqlarini
aniqlash   uchun   DNK   ma'lumotlar   bazasini   yuritadi.   Mudofaa   departamenti   sarum
ombori 50 000 000 dan ortiq yozuvlarni saqlaydi, birinchi navbatda inson qoldiqlarini
aniqlashga  yordam  beradi. DNK namunalarini  topshirish amerikalik harbiylar  uchun
majburiydir,   biroq   ma lumotlar   bazasida   harbiy   qaramog idagilar   haqidagiʼ ʻ
ma lumotlar   ham   mavjud.   2003   yildagi   Milliy   mudofaa   ruxsatnomasi   to'g'risidagi	
ʼ
qonun   federal   sudlar   yoki   harbiy   sudyalar   uchun   to'plangan   DNK   ma'lumotlarini
tergov   yoki   jinoiy   jinoyat   yoki   har   qanday   jinsiy   jinoyatni   tergov   qilish   uchun
ishlatishga   buyruq   berish   uchun   vositani   taqdim   etdi.   DNK   ma'lumotlari   etarli
darajada mavjud.
Ribonuklein   kislotasi   (RNK)   -   bu   genlarni   kodlash,   dekodlash,   tartibga   solish
va   ifodalashda   turli   biologik   rollarda   muhim   bo'lgan   polimerik   molekula.   RNK   va
dezoksiribonuklein   kislotasi   (DNK)   nuklein   kislotalardir.   Lipidlar,   oqsillar   va
uglevodlar   bilan   bir   qatorda   nuklein   kislotalar   hayotning   barcha   ma'lum   shakllari
uchun   zarur   bo'lgan   to'rtta   asosiy   makromolekulalardan   birini   tashkil   qiladi.   DNK
singari, RNK ham nukleotidlar zanjiri sifatida yig'iladi, lekin DNKdan farqli o'laroq,
RNK   tabiatda   juftlashgan   qo'sh   zanjir   emas,   balki   o'ziga   buklangan   bitta   ip   sifatida
topiladi. Hujayra organizmlari irsiy ma'lumotni (guanin, urasil, adenin va sitozinning
azotli asoslaridan foydalangan holda, G, U, A va C harflari bilan belgilanadi) etkazish
uchun messenjer  RNK (mRNK) dan foydalanadi, bu esa o'ziga xos oqsillar sintezini
boshqaradi.   Ko'pgina   viruslar   o'zlarining   genetik   ma'lumotlarini   RNK   genomi
yordamida   kodlaydilar.   Ba'zi   RNK   molekulalari   biologik   reaktsiyalarni   katalizlash,
16 gen   ifodasini   nazorat   qilish   yoki   hujayra   signallariga   javoblarni   sezish   va   etkazish
orqali   hujayralar   ichida   faol   rol   o'ynaydi.   Ushbu   faol   jarayonlardan   biri   oqsil
sintezidir,   bu   universal   funktsiya   bo'lib,   RNK   molekulalari   oqsillarni   sintezini
ribosomalarga   yo'naltiradi.   Bu   jarayon   aminokislotalarni   ribosomaga   etkazish   uchun
transfer   RNK   (tRNK)   molekulalaridan  foydalanadi,   bu  erda   ribosoma   RNK   (rRNK)
keyin   kodlangan   oqsillarni   hosil   qilish   uchun   aminokislotalarni   birlashtiradi.
RNKdagi   har   bir   nukleotid   tarkibida   1'   dan   5'   gacha   raqamlangan   uglerodli   riboza
shakar   mavjud.   Baza   1'   pozitsiyasiga   biriktirilgan,   umuman   olganda,   adenin   (A),
sitozin   (C),   guanin   (G)   yoki   urasil   (U).   Adenin   va   guanin   purinlar,   sitozin   va   urasil
pirimidinlardir.   Fosfat   guruhi   bir   ribozaning   3'   pozitsiyasiga   va   keyingisining   5'
pozitsiyasiga   biriktirilgan.   Fosfat   guruhlari   har   biri   manfiy   zaryadga   ega   bo'lib,
RNKni   zaryadlangan   molekulaga   (polianion)   aylantiradi.   Asoslar   sitozin   va   guanin,
adenin va urasil va guanin bilan urasil  o'rtasida vodorod bog'larini hosil  qiladi.   Shu
bilan  birga,  boshqa  o'zaro  ta'sirlar  ham  mumkin,  masalan,   bo'rtiq  shaklida  bir-biriga
bog'langan   adenin   asoslari   guruhi   yoki   guanin-adenin   tayanch   juftligiga   ega   bo'lgan
GNRA tetraloop. RNKni DNKdan ajratib turuvchi muhim tarkibiy komponenti riboza
shakarining   2'   pozitsiyasida   gidroksil   guruhining   mavjudligidir.   Ushbu   funktsional
guruhning   mavjudligi   spiralning   asosan   A   shaklidagi   geometriyasini   olishiga   olib
keladi, garchi bir zanjirli dinukleotid kontekstida RNK kamdan-kam hollarda DNKda
eng   ko'p   kuzatiladigan   B   shaklini   qabul   qilishi   mumkin.   A   shaklidagi   geometriya
natijasida juda chuqur va tor asosiy truba va sayoz va keng kichik truba paydo bo'ladi.
2'-gidroksil   guruhi   mavjudligining   ikkinchi   natijasi   shundaki,   RNK   molekulasining
konformatsion moslashuvchan hududlarida (ya'ni qo'sh spiral hosil bo'lishida ishtirok
etmaydi)   u   qo'shni   fosfodiester   bog'lanishiga   kimyoviy   hujum   qilib,   orqa   miyani
parchalashi  mumkin.  RNK   faqat   to'rtta  asos  (adenin,  sitozin,   guanin  va  urasil)   bilan
transkripsiyalanadi, ammo bu asoslar va biriktirilgan shakarlar RNKlar etuk bo'lganda
ko'p   usullar   bilan   o'zgartirilishi   mumkin.   Pseudouridin   (P),   bunda   urasil   va   riboza
o'rtasidagi   bog'liqlik   C-N   bog'idan   C-C   bog'iga   o'zgaradi   va   ribotimidin   (T)   turli
17 joylarda   topiladi   (eng   diqqatga   sazovorlari   tRNKning   TRC   halqasida)   Yana   bir
e'tiborga loyiq o'zgartirilgan asos - bu gipoksantin, deaminatsiyalangan adenin asosi,
uning   nukleozidi   inozin   (I)   deb   ataladi.   Inozin   genetik   kodning   chayqalish
gipotezasida   asosiy   rol   o'ynaydi.   100   dan   ortiq   boshqa   tabiiy   ravishda   o'zgartirilgan
nukleozidlar mavjud. Modifikatsiyalarning eng katta tarkibiy xilma-xilligini tRNKda
topish mumkin, rRNKda ko'pincha mavjud bo'lgan psevduridin va 2'-O-metilribozali
nukleozidlar   esa   eng   keng   tarqalgan.   Ushbu   modifikatsiyalarning   ko'pchiligining
RNKdagi o'ziga xos rollari to'liq tushunilmagan. Shunisi e'tiborga loyiqki, ribosomal
RNKda transkripsiyadan keyingi ko'plab modifikatsiyalar peptidil transferaza markazi
va   subunit   interfeysi   kabi   yuqori   funktsional   hududlarda   sodir   bo'ladi,   bu   ularning
normal faoliyat uchun muhimligini anglatadi.
18 2.3. DNK va RNK nukleotid bazakari ketma-ketliklari
Bioinformatika   sohasida   ketma-ketlik   ma'lumotlar   bazasi   -   bu   kompyuterda
saqlanadigan   kompyuterlashtirilgan   ("raqamli")   nuklein   kislotalar   ketma-ketliklari,
oqsillar   ketma-ketliklari   yoki   boshqa   polimer   ketma-ketliklarining   katta   to'plamidan
tashkil   topgan   biologik   ma'lumotlar   bazasi   turi.   UniProt   ma'lumotlar   bazasi   oqsillar
ketma-ketligi ma'lumotlar bazasiga misoldir. 2013 yil holatiga ko'ra, u 40 milliondan
ortiq   ketma-ketlikni   o'z   ichiga   olgan   va   eksponent   tezlikda   o'sib   bormoqda.   Tarixiy
jihatdan   ketma-ketliklar   qog'oz   shaklida   nashr   etilgan,   ammo   ketma-ketliklar   soni
oshgani sayin, bu saqlash usuli barqaror bo'lmagan. Nuklein kislotalar ketma-ketligi -
bu   DNK   (GACT   yordamida)   yoki   RNK   (GACU)   molekulasida   allel   hosil   qiluvchi
nukleotidlarning   tartibini   ko'rsatadigan   besh   xil   harflar   to'plami   bilan   ifodalangan
asoslar ketma-ketligi. An'anaga ko'ra, ketma-ketliklar odatda 5' oxiridan 3' oxirigacha
taqdim etiladi. DNK uchun sezgi zanjiri ishlatiladi. Nuklein kislotalar odatda chiziqli
(tarmoqlanmagan)   polimerlar   bo'lganligi   sababli,   ketma-ketlikni   ko'rsatish   butun
molekulaning   kovalent   tuzilishini   aniqlashga   teng.   Shu   sababli,   nuklein   kislotalar
ketma-ketligi   birlamchi   tuzilish   deb   ham   ataladi.   Ketma-ket   ma'lumotni   ifodalash
qobiliyatiga   ega.   Biologik   deoksiribonuklein   kislotasi   organizmning   funktsiyalarini
boshqaradigan ma'lumotni ifodalaydi. Nuklein kislotalar ham ikkilamchi va uchinchi
darajali   tuzilishga   ega.   Birlamchi   tuzilma   ba'zan   noto'g'ri   tarzda   birlamchi   ketma-
ketlik   deb   ataladi.   Aksincha,   ikkilamchi   yoki   uchinchi   darajali   ketma-ketlikning
parallel tushunchasi mavjud emas.
19 RNKning kimyoviy tuzilishi
Nuklein   kislotalar   nukleotidlar   deb   ataladigan   bog'langan   birliklar   zanjiridan
iborat.   Har   bir   nukleotid   uchta   bo'linmadan   iborat:   fosfat   guruhi   va   shakar   (RNKda
riboza,   DNKda   dezoksiriboza)   nuklein   kislota   zanjirining   asosini   tashkil   qiladi   va
shakar   bilan   biriktirilgan   nukleobazalar   to'plamidan   biridir.   Nukleobazalar   yuqori
darajadagi   ikkilamchi   va   uchinchi   darajali   tuzilmalarni,   masalan,   mashhur   qo'shaloq
spiralni hosil  qilish uchun iplarning asosiy  juftlashuvida  muhimdir. Mumkin bo'lgan
harflar   A,   C,   G   va   T   bo'lib,   fosfodiester   magistraliga   kovalent   bog'langan   DNK
zanjirining   to'rtta   nukleotid   asoslarini   -   adenin,   sitozin,   guanin,   timinni   ifodalaydi.
Odatdagi   holatda   ketma-ketliklar   bir-biriga   yopishgan   holda   bo'shliqlarsiz   chop
etiladi,   AAAGTCTGAC   ketma-ketligidagi   kabi,   chapdan   o'ngga   5'   dan   3'   gacha
o'qiladi. Transkripsiyaga kelsak, agar u transkripsiyalangan RNK bilan bir xil tartibda
bo'lsa,   kodlash   zanjirida   ketma-ketlik   mavjud.   Bitta   ketma-ketlik   boshqa   ketma-
ketlikni to'ldiruvchi bo'lishi mumkin, ya'ni ular to'ldiruvchi (ya'ni, A dan T, C dan G
20 gacha)   va   teskari   tartibda   har   bir   pozitsiyada   asosga   ega.   Masalan,   TTAC   ni
to'ldiruvchi   ketma-ketlik   GTAA   dir.   Agar   ikki   zanjirli   DNKning   bir   zanjiri   sezgi
zanjiri   deb   hisoblansa,   antisens   deb   hisoblangan   ikkinchi   zanjir   sezgi   zanjiriga
komplementar ketma-ketlikka ega bo'ladi. 
mRNK molekulasining bir qismidagi bir qator kodonlar. Har bir kodon odatda
bitta   aminokislotani   ifodalovchi   uchta   nukleotiddan   iborat.   Ikki   nukleotid   ketma-
ketligi orasidagi % farqni solishtirish va aniqlash.
 AATCCGCTAG
 AAACCCTTAG
Ikkita  10-nukleotid  ketma-ketligini  hisobga   olib,  ularni  bir   qatorga  qo'ying  va
ular   orasidagi   farqlarni   solishtiring.   Turli   DNK   asoslari   sonini   nukleotidlarning
umumiy soniga bo'lish orqali foiz o'xshashligini  hisoblang. Yuqoridagi holatda 10 ta
nukleotid ketma-ketligida uchta farq mavjud. Shuning uchun, 70% o'xshashlikni olish
uchun 7/10 ni bo'ling va 30% farqni olish uchun 100% dan ayirib tashlang. A, T, C va
G bir pozitsiyada ma'lum bir nukleotidni ifodalasa-da, noaniqlikni ifodalovchi harflar
ham   mavjud   bo'lib,   ular   ushbu   pozitsiyada   bir   nechta   turdagi   nukleotidlar   paydo
bo'lishi   mumkin   bo'lganda   ishlatiladi.   Xalqaro   toza   va   amaliy   kimyo   ittifoqining
(IUPAC) qoidalari quyidagilardan iborat:
21 Bu   belgilar   RNK   uchun   ham   amal   qiladi,   faqat   U   (urasil)   T   (timin)   o'rnini
bosadi. Adenin (A), sitozin (C), guanin (G), timin (T) va urasil (U) dan tashqari, DNK
va RNK nuklein kislotalar zanjiri hosil bo'lgandan keyin o'zgartirilgan asoslarni ham
o'z   ichiga   oladi.   DNKda   eng   keng   tarqalgan   modifikatsiyalangan   asos   5-
metilsitidindir   (m5C).   RNKda   psevduridin   (P),   dihidroridin   (D),   inozin   (I),
ribotimidin (rT)  va 7-metilguanozin (m7G)  kabi  ko'plab modifikatsiyalangan asoslar
mavjud.  Gipoksantin   va   ksantin   mutagen   mavjudligi   natijasida   hosil   bo'lgan   ko'plab
asoslarning   ikkitasi   bo'lib,   ularning   ikkalasi   ham   dezaminlanish   (amin   guruhini
karbonil   guruhi   bilan   almashtirish).   Gipoksantin   adenindan,   ksantin   esa   guanindan
ishlab   chiqariladi.   Xuddi   shunday,   sitozinning   dezaminlanishi   natijasida   urasil   hosil
bo'ladi.   Biologik   tizimlarda   nuklein   kislotalar   tirik   hujayra   tomonidan   ma'lum
oqsillarni   yaratish   uchun   ishlatiladigan   ma'lumotlarni   o'z   ichiga   oladi.   Nuklein
kislotasi   zanjiridagi   nukleobazalar   ketma-ketligi   hujayra   apparati   tomonidan   oqsil
zanjirini   tashkil   etuvchi   aminokislotalar   ketma-ketligiga   aylantiriladi.   Kodon   deb
ataladigan   uchta   asosning   har   bir   guruhi   bitta   aminokislotaga   mos   keladi   va   uchta
asosning har bir mumkin bo'lgan birikmasi ma'lum bir aminokislotaga mos keladigan
o'ziga xos genetik kod mavjud. Molekulyar biologiyaning markaziy dogmasi nuklein
22 kislotalar   tarkibidagi   ma'lumotlardan   foydalangan   holda   oqsillarni   qurish
mexanizmini   belgilaydi.   DNk   mRNK   molekulalariga   transkripsiya   qilinadi,   ular
ribosomaga   boradi,   u   erda   mRNK   oqsil   zanjirini   qurish   uchun   shablon   sifatida
ishlatiladi.   Nuklein   kislotalar   bir-birini   to'ldiruvchi   ketma-ketliklarga   ega   bo'lgan
molekulalar   bilan   bog'lanishi   mumkinligi   sababli,   oqsillarni   kodlaydigan   "sezuvchi"
ketma-ketliklar   va   o'z-o'zidan   ishlamaydigan,   ammo   sezgi   zanjiri   bilan   bog'lanishi
mumkin bo'lgan to'ldiruvchi "antisens" ketma-ketligi o'rtasida farq bor. DNK ketma-
ketligi  - berilgan DNK fragmentining nukleotidlar  ketma-ketligini  aniqlash  jarayoni.
Tirik   mavjudotning   DNKsi   ketma-ketligi   ushbu   tirik   mavjudotning   yashashi   va
ko'payishi uchun zarur bo'lgan ma'lumotlarni kodlaydi. Shuning uchun ketma-ketlikni
aniqlash   organizmlarning   nima   uchun   va   qanday   yashashi   haqidagi   fundamental
tadqiqotlarda, shuningdek, amaliy mavzularda foydalidir. DNKning tirik mavjudotlar
uchun   ahamiyati   tufayli   DNK   ketma-ketligi   haqidagi   bilimlar   deyarli   har   qanday
biologik   tadqiqotlarda   foydali   bo'lishi   mumkin.   Masalan,   tibbiyotda   u   genetik
kasalliklarni   aniqlash,   tashxislash   va   davolash   usullarini   ishlab   chiqish   uchun
ishlatilishi   mumkin.   Xuddi   shunday,   patogenlarni   o'rganish   yuqumli   kasalliklarni
davolashga   olib   kelishi   mumkin.   Biotexnologiya   ko'plab   foydali   mahsulotlar   va
xizmatlar uchun potentsialga ega rivojlanayotgan fandir.
RNK   to'g'ridan-to'g'ri   ketma-ket   emas.   Buning   o'rniga,   u   teskari   transkriptaza
orqali DNKga ko'chiriladi va bu DNK keyinchalik ketma-ketlashtiriladi.
Dastlab,   tartibga   soluvchi   RNK   eukaryotik   hodisa   deb   hisoblangan,   bu   nima
uchun   yuqori   organizmlarda   prognoz   qilinganidan   ko'ra   ko'proq   transkripsiya
kuzatilganligini   tushuntirishning   bir   qismi.   Ammo   tadqiqotchilar   bakteriyalarda
mumkin   bo'lgan   RNK   regulyatorlarini   qidira   boshlashlari   bilanoq,   ular   kichik   RNK
(sRNK)   deb   atalgan.   Hozirgi   vaqtda   genlarni   RNK   tartibga   solish   tizimlarining
hamma   joyda   mavjud   tabiati   RNK   Jahon   nazariyasini   qo'llab-quvvatlash   sifatida
muhokama qilinmoqda. Bakterial kichik RNKlar odatda mRNK bilan antisens juftligi
orqali   harakat  qiladi   va uning  tarjimasini  pasaytiradi,  yoki   barqarorlikka  ta'sir   qiladi
23 yoki   cisni   bog'lash   qobiliyatiga   ta'sir   qiladi.   Riboswitchlar   ham   topilgan.   Ular
allosterik   ta'sir   qiluvchi   cis-ta'sir   qiluvchi   tartibga   soluvchi   RNK   ketma-ketliklari.
Ular   metabolitlarni   bog'laganda   shaklini   o'zgartiradilar,   shuning   uchun   ular   genlar
ekspressiyasini   tartibga   solish   uchun   xromatinni   bog'lash   qobiliyatiga   ega   bo'ladilar
yoki yo'qotadilar.
Ko'pgina RNKlar boshqa RNKlarni o'zgartirishda ishtirok etadi. Intronlar pre-
mRNKdan spliceosomalar tomonidan ajratiladi, ular tarkibida bir nechta kichik yadro
RNKlari   (snRNK)   yoki   intronlar   o'z-o'zidan   birlashtirilgan   ribozimlar   bo'lishi
mumkin.   RNK   nukleotidlarini   A,   C,   G   va   U   dan   boshqa   nukleotidlarga   o'zgartirish
orqali ham o'zgarishi mumkin. Eukariotlarda RNK nukleotidlarining modifikatsiyalari
odatda kichik yadroli RNKlar (snoRNK; 60-300 nt) tomonidan boshqariladi yadro va
kajal jismlarda. snoRNKlar fermentlar bilan bog'lanadi va ularni RNK bilan bog'lash
orqali   RNKdagi   nuqtaga   yo'naltiradi.   Keyinchalik   bu   fermentlar   nukleotid
modifikatsiyasini   amalga   oshiradi.   rRNK   va   tRNK   keng   ko'lamda   o'zgartirilgan,
ammo snRNK va mRNK ham asosiy modifikatsiyaning maqsadi bo'lishi mumkin.[60]
[61] RNK ham metillangan bo'lishi mumkin
Arxeyada ham tartibga soluvchi RNK tizimlari mavjud. Yaqinda DNKni in situ
tahrirlash uchun foydalanilayotgan CRISPR tizimi arxeya va bakteriyalardagi tartibga
soluvchi RNKlar orqali virus bosqinchilaridan himoya qiladi.
Hozirgi   ketma-ketlik   usullari   DNK   polimerazalarining   diskriminatsiya
qobiliyatiga tayanadi va shuning uchun faqat to'rtta asosni ajrata oladi. Inozin (RNKni
tahrirlash jarayonida adenozindan hosil bo'lgan) G sifatida o'qiladi va 5-metil-sitozin
(DNK   metilatsiyasi   natijasida   sitozindan   hosil   bo'lgan)   C   sifatida   o'qiladi.   Hozirgi
texnologiya bilan kichik miqdordagi  DNKni  ketma-ketlashtirish qiyin, chunki signal
o'lchash uchun juda zaif. Bu polimeraza zanjiri reaktsiyasi (PCR) kuchaytirilishi bilan
bartaraf etiladi.  
24 DNK   ketma-ketligining   bir   qismini   aniqlash   uchun   avtomatlashtirilgan
sekvenserdan elektroferogrammani chop etish.
Organizmdan   nuklein   kislotalar   ketma-ketligi   olingandan   so'ng,   u   raqamli
formatda   kremniyda   saqlanadi.   Raqamli   genetik   ketma-ketliklar   ketma-ketlik
ma'lumotlar   bazalarida   saqlanishi,   tahlil   qilinishi   mumkin   (quyidagi   ketma-ketlik
tahliliga   qarang),   raqamli   ravishda   o'zgartirilishi   va   sun'iy   gen   sintezi   yordamida
yangi haqiqiy DNKni yaratish uchun shablon sifatida ishlatilishi  mumkin. Organizm
genomidagi   DNK   irsiy   kasalliklarga   nisbatan   zaifliklarni   aniqlash   uchun   tahlil
qilinishi mumkin, shuningdek, bolaning otaligini (genetik otasi) yoki insonning nasl-
nasabini aniqlash uchun ishlatilishi mumkin. Odatda, har bir odamda har bir genning
ikkita   varianti   mavjud   bo'lib,   biri   onasidan,   ikkinchisi   otasidan   meros   bo'lib   o'tadi.
Inson genomida 20 000-25 000 ga yaqin gen borligi taxmin qilinadi. Xromosomalarni
individual   genlar   darajasiga   o'rganishdan   tashqari,   kengroq   ma'noda   genetik   test
genetik   kasalliklarning   mavjudligi   yoki   genetik   kasalliklarning   rivojlanish   xavfi
ortishi   bilan   bog'liq   bo'lgan   mutant   shakllarining   mavjudligi   uchun   biokimyoviy
testlarni o'z ichiga oladi.
Genetik   test   xromosomalar,   genlar   yoki   oqsillardagi   o'zgarishlarni   aniqlaydi.
Odatda,   test   irsiy   kasalliklar   bilan   bog'liq   o'zgarishlarni   aniqlash   uchun   ishlatiladi.
Genetik test natijalari shubhali irsiy holatni tasdiqlashi yoki rad etishi yoki odamning
25 genetik   kasallikni   rivojlanish   yoki   o'tish   imkoniyatini   aniqlashga   yordam   beradi.
Hozirda   bir   necha   yuz   genetik   testlar   qo'llanilmoqda   va   yana   ko'plari   ishlab
chiqilmoqda.   Bioinformatikada   ketma-ketlikni   moslashtirish   DNK,   RNK   yoki   oqsil
ketma-ketliklarini   tartibga   solish   usuli   bo lib,   ular   ketma-ketliklar   orasidagiʻ
funktsional,   strukturaviy   yoki   evolyutsion   munosabatlarga   bog liq   bo lishi   mumkin	
ʻ ʻ
bo lgan   o xshashlik   hududlarini   aniqlashdir.[9]   Agar   hizalanishdagi   ikkita   ketma-	
ʻ ʻ
ketlik umumiy ajdodga ega bo'lsa, nomuvofiqliklar nuqta mutatsiyalari va bo'shliqlar
bir-biridan   ajralib   chiqqan   vaqt   ichida   bir   yoki   ikkala   naslda   kiritilgan   kiritish   yoki
o'chirish mutatsiyalari (indellar) sifatida talqin qilinishi mumkin. Oqsillarning ketma-
ket   joylashishida   ketma-ketlikda   ma'lum   bir   pozitsiyani   egallagan   aminokislotalar
o'rtasidagi o'xshashlik darajasini ma'lum bir mintaqa yoki ketma-ketlik motivi nasllar
orasida   qanchalik   saqlanib   qolganligining   taxminiy   o'lchovi   sifatida   talqin   qilish
mumkin.   Ketma-ketlikning   ma'lum   bir   hududida   almashtirishlarning   yo'qligi   yoki
faqat   juda   konservativ   almashtirishlarning   mavjudligi   (ya'ni   yon   zanjirlari   o'xshash
biokimyoviy   xususiyatlarga   ega   bo'lgan   aminokislotalarning   o'rnini   bosishi)   bu
mintaqaning tarkibiy yoki funktsional ahamiyatga ega ekanligini ko'rsatadi.. DNK va
RNK   nukleotid   asoslari   aminokislotalarga   qaraganda   bir-biriga   ko'proq   o'xshash
bo'lsa-da,   asos   juftlarining   saqlanishi   o'xshash   funktsional   yoki   strukturaviy   rolni
ko'rsatishi mumkin.
Hisoblash filogenetikasi filogenetik daraxtlarni qurish va talqin qilishda ketma-
ketlikni   tekislashdan   keng   foydalanadi,   ular   turli   xil   turlarning   genomlarida
ifodalangan   homolog   genlar   orasidagi   evolyutsion   munosabatlarni   tasniflash   uchun
ishlatiladi.   So'rovlar   to'plamidagi   ketma-ketliklarning   farqlanish   darajasi   ketma-
ketliklarning   bir-biridan   evolyutsion   masofasiga   sifat   jihatidan   bog'liq.   Taxminan
aytganda,   yuqori   ketma-ketlik   identifikatsiyasi   ko'rib   chiqilayotgan   ketma-
ketliklarning   nisbatan   yosh   eng   so'nggi   umumiy   ajdodi   borligini   ko'rsatadi,   past
identifikatsiya   esa   tabaqalanish   qadimgiroq   ekanligini   ko'rsatadi.   “Molekulyar   soat”
gipotezasini   aks   ettiruvchi,   evolyutsion   o‘zgarishlarning   taxminan   doimiy   tezligidan
26 ikki gen birinchi bo‘lib ajralib chiqqanidan beri o‘tgan vaqtni (ya’ni birlashish vaqti)
ekstrapolyatsiya qilish uchun foydalanish mumkinligi haqidagi gipoteza mutatsiya va
tanlanishning   ta’sirini   ko‘rsatadi.   ketma-ketlik   qatorlari   bo'ylab   doimiy.   Shuning
uchun u organizmlar yoki turlar o'rtasidagi DNKni tiklash tezligidagi mumkin bo'lgan
farqlarni   yoki   ketma-ketlikda   muayyan   hududlarning   mumkin   bo'lgan   funktsional
saqlanishini   hisobga   olmaydi.   (Nukleotidlar   ketma-ketligi   bo'lsa,   molekulyar   soat
gipotezasi   eng   asosiy   shaklda,   shuningdek,   ma'lum   bir   kodonning   ma'nosini
o'zgartirmaydigan jim mutatsiyalar va boshqa aminokislotalarning tarkibiga kirishiga
olib   keladigan   boshqa   mutatsiyalar   o'rtasidagi   qabul   qilish   tezligidagi   farqni
kamaytiradi. Protein.) Statistik jihatdan aniqroq usullar filogenetik daraxtning har bir
shoxidagi evolyutsiya tezligini o'zgartirishga imkon beradi va shu bilan genlar uchun
birlashish vaqtlarini yaxshiroq baholash imkonini beradi. DNK segmentining ketma-
ketligini   bilish   juda   ko'p   maqsadlarga   ega   va   undan   keyin   ba'zi   misollar   keltirilgan.
Birinchidan,   u   ma'lum   bir   protein   yoki   fenotipni   kodlaydigan   genlarni,   DNK
segmentlarini   topish   uchun   ishlatilishi   mumkin.   Agar   DNKning   bir   hududi   ketma-
ketlashtirilgan   bo'lsa,   uni   genlarning   xarakterli   xususiyatlari   uchun   tekshirish
mumkin.   Masalan,   ochiq   o'qish   ramkalari   (ORF)   -   boshlang'ich   kodon   bilan
boshlanadigan   (uch   qo'shni   nukleotid;   kodon   ketma-ketligi   aminokislotalarni   ishlab
chiqarishni   belgilaydi)   va   to'xtash   kodonlari   bilan   uzluksiz   bo'lgan   (ularning
tugashida bittasi bundan mustasno) uzoq ketma-ketliklarni taklif qiladi. oqsil kodlash
hududi.   Shuningdek,   inson   genlari   odatda   CpG   orollari   deb   ataladigan   orollarga   -
DNKni tashkil etuvchi nukleotidlarning ikkitasi bo'lgan sitozin va guanin klasterlariga
qo'shni bo'ladi. Agar ma'lum fenotipga ega bo'lgan gen (masalan, odamlarda kasallik
geni)   xromosoma   mintaqasida   ketma-ket   joylashganligi   ma'lum   bo'lsa,   mintaqadagi
tayinlanmagan   genlar   ushbu   funktsiyaga   nomzod   bo'ladi.   Ikkinchidan,   turli
organizmlarning gomologik DNK ketma-ketliklarini turlar ichida ham, o rtasida hamʻ
evolyutsion   munosabatlarni   tuzish   uchun   solishtirish   mumkin.   Uchinchidan,   genlar
ketma-ketligi   funktsional   hududlar   uchun   tekshirilishi   mumkin.   Gen   funktsiyasini
27 aniqlash  uchun   o'xshash  funktsiyali   oqsillar   uchun  umumiy  bo'lgan  turli   domenlarni
aniqlash mumkin. Masalan, gen ichidagi ma'lum aminokislotalar ketma-ketligi doimo
hujayra  membranasini   qamrab olgan  oqsillarda topiladi;   bunday aminokislotalarning
cho'zilishi   transmembran   domenlari   deb   ataladi.   Agar   transmembran   domen
noma'lum   funktsiyali   genda   topilsa,   bu   kodlangan   oqsilning   hujayra   membranasida
joylashganligini   ko'rsatadi.   Boshqa   domenlar   DNKni   bog'laydigan   oqsillarni
tavsiflaydi.   DNK   ketma-ketliklarining   bir   nechta   ommaviy   ma'lumotlar   bazalari   har
qanday   manfaatdor   shaxs   tomonidan   tahlil   qilish   uchun   mavjud.   Ikki   asosiy   ketma-
ketlik   yondashuvlari   amerikalik   molekulyar   biologlar   Allan   M.   Maxam   va   Valter
Gilbert   tomonidan   kashf   etilgan   va   nomini   olgan   Maxam-Gilbert   usuli   va   ingliz
biokimyogari   Frederik   Sanger   tomonidan   kashf   etilgan   Sanger   usulidir.   Eng   ko'p
qo'llaniladigan Sanger usulida DNK zanjirlari shablon zanjirida sintezlanadi, lekin 3'
gidroksil guruhiga ega bo'lmagan to'rtta mumkin bo'lgan dideoksi nukleotidlardan biri
kiritilganda zanjir  o'sishi  to'xtatiladi  va shu  bilan boshqasining  qo'shilishining  oldini
oladi.   nukleotid.   Yuvalangan,   kesilgan   DNK   molekulalarining   populyatsiyasi   DNK
shablonidagi   ushbu   nukleotidning   har   bir   joyini   ifodalaydi.   Bu   molekulalar
elektroforez   deb   ataladigan   protsedurada   ajratiladi   va   xulosa   qilingan   nukleotidlar
ketma-ketligi kompyuter yordamida chiqariladi. 
Klonlangan   DNKning   yana   bir   qo'llanilishi   in   vitro   mutagenez   bo'lib,   unda
klonlangan   DNK   segmentida   mutatsiya   hosil   bo'ladi.   Keyin   DNK   hujayra   yoki
organizmga   kiritiladi   va   mutatsiyaning   ta'siri   o'rganiladi.   Mutatsiyalar   genetiklar
uchun   har   qanday   biologik   jarayonning   tarkibiy   qismlarini   o'rganish   imkonini
berishda   foydalidir.   Biroq,   an'anaviy   mutatsion   tahlil   tasodifiy   o'z-o'zidan   paydo
bo'lgan   mutatsiyalarning   paydo   bo'lishiga   tayangan   -   bu   zarba   yoki   o'tkazib
yuborilgan   usul   bo'lib,   unda   olingan   mutatsiyalarning   aniq   turini   yoki   holatini
oldindan   aytib   bo'lmaydi.   Biroq,   in   vitro   mutagenez   o'ziga   xos   mutatsiyalarni   gen
ichidagi   joylashuvi   va   turiga   moslashtirishga   imkon   beradi.   Klonlangan   gen   kerakli
mutatsiyani   olish   uchun   probirkada   (in   vitro)   davolanadi,   so'ngra   bu   fragment   tirik
28 hujayraga qayta kiritiladi va u erda rezident gen o'rnini egallaydi. In vitro mutagenez
usullaridan biri oligonukleotidga yo'naltirilgan mutagenezdir. Mutatsiya uchun ketma-
ket gendagi ma'lum bir nuqta aniqlanadi. Kerakli ketma-ketlikdagi sintetik DNKning
qisqa   qismi   bo'lgan   oligonukleotid   kimyoviy   usulda   hosil   bo'ladi.   Masalan,
oligonukleotid   guanin   o'rniga   ma'lum   bir   joyda   adeninga   ega   bo'lishi   mumkin.   Bu
oligonukleotid   klonlangan   genning   komplementar   zanjiriga   gibridlanadi;   u   bir
tayanch juftlik nomuvofiqligiga qaramay gibridlanadi. Oligonukleotid vektor ichidagi
to'liq zanjirning sintezini boshlash uchun turli fermentlar qo'shiladi. Vektor bakteriya
hujayrasiga   kiritilganda   va   replikatsiya   qilinganida,   mutatsiyaga   uchragan   ip   ham
mutant bo'ladigan qo'shimcha  zanjir uchun shablon bo'lib xizmat qiladi va shu bilan
to'liq   mutant   molekula   olinadi.   Bu   to'liq   mutant   klonlangan   molekula   keyin   donor
organizmga   qayta   kiritiladi   va   mutant   DNK   rezident   gen   o'rnini   egallaydi.   Sanger
sekvensiyasi   qanday   ishlashini   tushunish   uchun,   avvalo,   tabiatda   mavjud   bo'lgan
DNK   replikatsiyasi   jarayonini   tushunish   kerak.   DNK   ikki   zanjirli,   spiralsimon
molekula   bo'lib,   nukleotidlardan   tashkil   topgan   bo'lib,   ularning   har   birida   fosfat
guruhi, qand molekulasi va azotli asos mavjud. To'rtta tabiiy azotli asoslar mavjudligi
sababli,   to'rt   xil   DNK   nukleotidlari   mavjud:   adenin   (A),   timin   (T),   guanin   (G)   va
sitozin   (C).   Ikki   zanjirli   DNK   ichida   bir   zanjirdagi   azotli   asoslar   ikkinchi   zanjir
bo'ylab komplementar asoslar bilan juft; xususan, A har doim T bilan, C esa G bilan
juftlashadi.   Keyin   DNK   replikatsiyasi   paytida   qo'sh   spiraldagi   ikkita   ip   ajralib
chiqadi. Bu DNK polimeraza deb ataladigan fermentga har bir zanjirga alohida kirish
imkonini   beradi   (1-rasm).   DNK   polimeraza   bir   zanjirli   DNK   bo'ylab   pastga
siljiganida,   replikatsiya   uchun   shablon   sifatida   ushbu   zanjirdagi   nukleotidlar   ketma-
ketligidan foydalanadi. Shunday qilib, har doim DNK polimeraza shablon zanjiridagi
T   ni   tanisa,   u   qurayotgan   to'ldiruvchi   qiz   zanjiriga   A   qo'shadi;   xuddi   shunday,
qachonki u asl ipda C ga duch kelsa, u qiz ipga G ni qo'shadi. Bu jarayon bir vaqtning
o'zida   ikkala   zanjir   bo'ylab   sodir   bo'ladi,   natijada   har   birida   bitta   "eski"   va   bitta
"yangi"   DNK   zanjiri   bo'lgan   ikkita   qo'sh   spiral   molekula   hosil   bo'ladi.   Sanger   usuli
29 DNK segmentidagi nukleotidlar ketma-ketligini aniqlash uchun yuqorida tavsiflangan
replikatsiya   jarayonining   o'zgarishiga   tayanadi.   Sanger   sekvensiyasini   boshlashdan
oldin   tadqiqotchilar   birinchi   navbatda   o'zlari   ketma-ket   joylashtirmoqchi   bo'lgan
DNK segmentining ko'p nusxalarini olishlari yoki kuchaytirishlari kerak. Bu DNKni
klonlash   yoki   polimeraza   zanjiri   reaktsiyasini   (PCR)   ishga   tushirish   orqali   amalga
oshiriladi.   DNK   kuchaytirilgandan   so'ng,   u   ikkita   ipni   ajratish   uchun   qizdiriladi   va
aralashmaga   sintetik   primer   qo'shiladi.   Primer   ketma-ketligi   maqsadli   DNKning
birinchi   bo'lagini   to'ldiradi,   ya'ni   primer   va   DNK   nishoni   bir-biri   bilan   bog'lanadi.
Ushbu   nuqtada   maqsadli   ketma-ketlik   DNK   polimeraza   va   qo'shimcha   DNK   zanjiri
sintezi   uchun   zarur   bo'lgan   barcha   nukleotidlarni   o'z   ichiga   olgan   eritma   bilan
ta'sirlanadi - bitta maxsus tarkibiy qism.
Deoksiribonuklein   kislotasi   (/di ks ra bo nju kli k,   - kle -/   (tinglash);[1]ːˈɒ ɪˌ ɪ ʊ ːˌ ːɪ ˌ ɪ
DNK)   bir-birining   atrofida   aylanib,   qo sh   spiral   hosil   qiluvchi   ikkita   polinukleotid
ʻ
zanjiridan   tashkil   topgan   polimerdir.  Polimer   barcha   ma'lum   organizmlar   va   ko'plab
viruslarning   rivojlanishi,   ishlashi,   o'sishi   va   ko'payishi   uchun   genetik  ko'rsatmalarga
ega.   DNK   va   ribonuklein   kislotasi   (RNK)   nuklein   kislotalardir.   Oqsillar,   lipidlar   va
murakkab   uglevodlar   (polisaxaridlar)   bilan   bir   qatorda   nuklein   kislotalar   hayotning
barcha ma'lum  shakllari  uchun zarur  bo'lgan to'rtta asosiy  makromolekula turlaridan
biridir.
Ikki DNK zanjiri polinukleotidlar deb nomlanadi, chunki ular nukleotidlar deb
ataladigan oddiy monomer birliklardan tashkil topgan.[2][3] Har bir nukleotid to'rtta
azot   o'z   ichiga   olgan   nukleobazalar   (sitozin   [C],   guanin   [G],   adenin   [A]   yoki   timin
[T]), deoksiriboza deb ataladigan shakar va fosfat guruhidan iborat. Nukleotidlar bir-
biri   bilan   zanjirda   bir   nukleotidning   shakari   va   keyingisining   fosfati   o'rtasidagi
kovalent   bog'lar   (fosfodiester   bog'lanishi   deb   nomlanadi)   bilan   bog'lanadi,   natijada
muqobil   shakar-fosfat   magistral   hosil   bo'ladi.   Ikki   alohida   polinukleotid   zanjirining
azotli   asoslari   juft   zanjirli   DNK   hosil   qilish   uchun   vodorod   bog'lari   bilan   tayanch
juftlik qoidalariga (A bilan T va C bilan G) muvofiq bir-biriga bog'langan. Bir-birini
30 to'ldiruvchi   azotli   asoslar   ikki   guruhga   bo'linadi:   pirimidinlar   va   purinlar.   DNKda
pirimidinlar   timin   va   sitozin;   purinlar   adenin   va   guanindir.   Ikki   zanjirli   DNKning
ikkala   zanjiri   ham   bir   xil   biologik   ma'lumotlarni   saqlaydi.   Ushbu   ma'lumot   ikki   ip
ajratilganda   takrorlanadi.   DNKning   katta   qismi   (odamlar   uchun   98%   dan   ortig'i)
kodlanmaydi,   ya'ni   bu   bo'limlar   oqsil   ketma-ketligi   uchun   naqsh   bo'lib   xizmat
qilmaydi. DNKning ikkita zanjiri bir-biriga qarama-qarshi  yo'nalishda harakat  qiladi
va   shuning   uchun   antiparalleldir.   Har   bir   shakarga   to'rt   turdagi   nukleobazalar   (yoki
asoslar)   biriktirilgan.   Aynan   shu   to'rtta   nukleobazaning   orqa   miya   bo'ylab   ketma-
ketligi   genetik   ma'lumotni   kodlaydi.   RNK   zanjirlari   transkripsiya   deb   ataladigan
jarayonda shablon sifatida DNK zanjirlari yordamida yaratiladi, bu erda DNK asoslari
o'zlarining mos  keladigan  asoslariga  almashtiriladi,  bundan  tashqari  timin (T),  RNK
urasil   (U)   o'rnini   bosadi.[4]   Genetik   kod   ostida,   bu   RNK   zanjirlari   translatsiya   deb
ataladigan jarayonda oqsillar ichidagi aminokislotalarning ketma-ketligini belgilaydi.
Eukaryotik   hujayralar   ichida   DNK   xromosomalar   deb   ataladigan   uzun
tuzilmalarga   bo'lingan.   Oddiy   hujayra   bo'linishidan   oldin,   bu   xromosomalar   DNK
replikatsiyasi  jarayonida ko'payadi  va har bir qiz hujayra uchun to'liq xromosomalar
to'plamini   ta'minlaydi.   Eukaryotik   organizmlar   (hayvonlar,   o'simliklar,   zamburug'lar
va   protistlar)   DNKning   katta   qismini   hujayra   yadrosida   yadro   DNKsi   sifatida,   bir
qismini   mitoxondriyal   DNK   sifatida   yoki   xloroplastlarda   xloroplast   DNKsi   sifatida
saqlaydi.   Bundan   farqli   o'laroq,   prokariotlar   (bakteriyalar   va   arxeyalar)   o'zlarining
DNKlarini   faqat   sitoplazmada,   aylana   xromosomalarda   saqlaydilar.   Eukaryotik
xromosomalar  ichida xromatin oqsillari, masalan, gistonlar, DNKni ixchamlashtiradi
va   tartibga   soladi.   Ushbu   siqilgan   tuzilmalar   DNK   va   boshqa   oqsillar   o'rtasidagi
o'zaro ta'sirlarni  boshqarib, DNKning qaysi  qismlari  transkripsiya qilinishini  nazorat
qilishga yordam beradi.
Yuqorida   ta'riflanganidek,   Sanger   jarayonidagi   navbatdagi   asosiy   qadam
maqsadli   ketma-ketlikni   DNK   polimeraza   va   barcha   to'rt   nukleotidning   muhim
miqdoriga   ta'sir   qilishdir.   Bog'lanmagan   shaklda   nukleotidlar   uchta   fosfat   guruhiga
31 ega va rasmiy ravishda deoksinukleotid trifosfatlar yoki dNTPlar deb ataladi (bu erda
"N" A, T, G yoki C uchun joy ushlagichdir). Yangi DNK zanjirini qurish jarayonida
gidroksil   guruhi   deb   ataladigan   molekula   (u   kislorod   atomi   va   vodorod   atomini   o'z
ichiga oladi) zanjirdagi oxirgi dNTP shakariga yopishadi va keyingi dNTPdagi fosfat
guruhi   bilan   kimyoviy   bog'lanadi.   Bu   bog'lanish   DNK   zanjirining   o'sishiga   olib
keladi.   Biroq,   Sanger   sekvensiyasida   o'sayotgan   DNK   zanjirini   o'rab   turgan   oddiy
dNTPlar   bilan   "qo'g'irchoq"   nukleotidning   maxsus   turi   mavjud.   Ushbu   maxsus
nukleotidlar dideoksinukleotid trifosfatlar yoki ddNTPlar deb nomlanadi (2-rasm) va
ularda dNTP shakariga biriktirilgan hal qiluvchi gidroksil guruhi yo'q. Shuning uchun
har   doim   o'sib   borayotgan   DNK   zanjiriga   ddNTP   qo'shilsa,   u   zanjirdagi   keyingi
nukleotid   bilan   kimyoviy   bog'lana   olmaydi   va   DNK   zanjiri   o'sishni   to'xtatadi.
Tadqiqotchilar   Sanger   jarayonini   amalga   oshirayotganda,   ular   bir   vaqtning   o'zida
shablon   zanjirining   ko'plab   nusxalarini   manipulyatsiya   qiladilar,   shuning   uchun
ddNTP qo'shilmaguncha DNK sintezi ushbu nusxalarda to'siqsiz davom etishi uchun
ko'p   miqdorda   dNTPlar   talab   qilinadi.   Keyin,   dNTPlarni   etkazib   berish   tugagandan
so'ng,   ketma-ketlik   tajribasining   yakuniy   natijasi   turli   uzunlikdagi   yangi   DNK
zanjirlari   guruhidir.   So'nggi   yillarda   DNK   sekvensiyasi   texnologiyasi   ilm-fanning
ko'plab   sohalarini   ilgari   surdi.   Masalan,   funktsional   genomika   sohasi   ma'lum   DNK
ketma-ketliklari   nima   qilishini,   shuningdek,   oqsillar   uchun   DNK   kodining   qaysi
qismlarini   va   muhim   tartibga   solish   funktsiyalariga   ega   ekanligini   aniqlash   bilan
bog'liq.   Ushbu   aniqlashni   amalga   oshirishda   bebaho   birinchi   qadam   bu
o'rganilayotgan DNK segmentlarining nukleotidlar ketma-ketligini o'rganishdir. DNK
ketma-ketligiga   tayanadigan   yana   bir   fan   sohasi   qiyosiy   genomika   bo'lib,
tadqiqotchilar   turli   organizmlarning   evolyutsion   tarixi   va   qarindoshlik   darajasini
bilish   uchun   ularning   genetik   materialini   solishtiradilar.   DNK   ketma-ketligi,
shuningdek,   olimlarga   turli   xil   sharoitlarga   moyilligiga   ta'sir   ko'rsatishi   mumkin
bo'lgan shaxslar o'rtasidagi ma'lum genetik o'zgarishlarni kataloglash imkonini berib,
murakkab kasalliklarni o'rganishga yordam berdi. 
32 33 III bob. Xulosa.
Individual darajada, insonning umumiy kasalliklarining sabablari  va yo'nalishi
bo'yicha   biotibbiy   tadqiqotlar   sog'liqni   saqlashni   sezilarli   darajada   yaxshilashga
qaratilgan.   Kasallikni   keltirib   chiqaradigan   genetik   variantlarni   aniqlashda   DNK
ketma-ketligini   qo'llash   genetik   testning   yaxshilanishi   va   kengayishiga,   shuningdek,
kelgusi   yillarda   ko'proq   maqsadli,   shaxsiylashtirilgan   dori   terapiyasining
rivojlanishiga   olib   keladi.   Bugungi   kunda   DNK   sekvensiyasining   afzalliklarini
qishloq  xo'jaligida kasalliklarga  chidamli   o'simliklar  va  hayvonlarni  ishlab  chiqarish
tufayli   ko'rish   mumkin.   Bundan   tashqari,   mikrob   genomlarini   sekvensiyalash
loyihalari   bir   kun   kelib   yangi   bioyoqilg'i   va   ifloslantiruvchi   moddalarni   monitoring
qilish tizimlarining rivojlanishiga olib kelishi mumkin. DNK ketma-ketligini aniqlash
usullari   sud-tibbiyot   fanida   ham   qo'llaniladi,   bu   jinoiy   ishlarda   muhim   dalillarni
taqdim etadi. Masalan, Amerika Qo'shma Shtatlarida Federal Qidiruv Byurosi (FQB)
jinoyat   sodir   bo'lgan   joyda   DNK   dalillari   olinganda   qidirilishi   mumkin   bo'lgan
ma'lum   jinoyatchilarning   genetik   profillarini   o'z   ichiga   olgan   milliy   ma'lumotlar
bazasini moliyalashtiradi va boshqaradi. FQB ma'lumotlariga ko'ra, 2008 yil holatiga
ko'ra,   ushbu   ma'lumotlar   bazasida   6,5   milliondan   ortiq   huquqbuzarlarning   profillari
mavjud bo'lib, deyarli 81 000 tergovda yordam bergan.
34 Foydalanilgan adabiyotlar:
1)   Xaksli   J.   1959.   Klasslar   va   sinflar.   Qobilda   A.J.   (tahrirlangan)   Vazifasi   va
taksonomik ahamiyati. Sistematik assotsiatsiya, London.
2)   Latreil,   P.A.   (1804).   Nouveau   Dictionnaire   à   Histoire   Naturelle,   xxiv;
Latreilda   keltirilgan,   P.A.   (1825).Familles   naturelles   du   règne   animal,   foshlar
qisqacha va dans un ordre analytique.
3)   a   b   Tudge,   Kolin   (2000).   Hayotning   xilma-xilligi.   Oksford   universiteti
matbuoti.
ISBN 0198604262.
4)   LAN,   R;   Rivz,   PR   (2002).   "Escherichia   coli   maskasi:   Shigellaning
molekulyar kelib chiqishi". Mikroblar va infektsiya / Institut Pasteri. 4 (11): 1125–32.
doi:10.1016 / S1286-4579 (02) 01637-
4. PMID 12361912.
5)   a   b   Grant,   Verne   (1998).   "Molekulyar   kladistika   bo'yicha   sharhlar   bilan
polemoniasiyalarning birlamchi tasnifi va filogeniyasi". Amerika botanika jurnali. 85
(6): 741–752.
doi:10.2307/2446408. JSTOR 2446408. PMID 21684957.
6) Sperling, E. A .; Pisani, D .; Peterson, K. J. (2007 yil 1-yanvar). "Poriferan
parafili va uning prekambriyadagi paleobiologiyaga ta'siri" (PDF). Geologik Jamiyat,
London, Maxsus nashrlar.
286   (1):   355–368.   Bibcode:2007GSLSP.286..355S.   doi:10.1144   /   SP286.25.
S2CID 34175521.
Arxivlandi asl nusxasi (PDF) 2009 yil 9 mayda. Olingan 22 avgust 2012.
7)   Donoghue,   Maykl   J.   (1   iyun   2005).   "Asosiy   yangiliklar,   yaqinlashish   va
muvaffaqiyat:   o'simlik   filogeniyasidan   makroevolyutsion   darslar"   (PDF).
Paleobiologiya. 31 (sp5): 77-93.
doi:10.1666 / 0094-8373 (2005) 031 [0077: KICASM] 2.0.CO; 2.
35

DNK va RNK nukleotidlar ketma-ketliklari ma’lumot bazalari

Купить
  • Похожие документы

  • Bojxona qo'mitasiga ishga kirish uchun savol javoblar toplami
  • Mitoxondriyalarda Са2+-transport sistemalarining tuzilishi, funksiyasi va ularga biologik faol moddalarning ta`siri
  • O`zbekistonga o`simliklarni introduksiya qilish tarixi va istiqbollari
  • Hujayradagi hayotiy jarayonlarning kechishida biomembranalarning roli
  • Nishon tumani Ch.Begimqulov jamoa xo`jaligiga qarashli maydonlardagi ihotazorlarning ahamiyati va bugungi ahvoli

Подтвердить покупку

Да Нет

© Copyright 2019-2026.

  • Инструкция по снятию с баланса
  • Контакты
  • Инструкция использования сайта
  • Инструкция загрузки документов
  • O'zbekcha